enzimi
definicija
Enzimi su kemijske tvari koje se mogu naći po cijelom tijelu. Oni pokreću kemijske reakcije u pokretu u tijelu.
povijest
Riječ enzim bio od Wilhelm Friedrich Kühne 1878 i potječe od grčke riječi enzim, što znači kvas ili kiselica. To je onda našlo svoj put u međunarodnu znanost. međunarodna unija čiste primijenjene kemije (IUPAC) i međunarodna unija biokemije (IUBMB) izradio nomenklaturu za enzime koja definira predstavnike ove velike skupine tvari kao zajedničku skupinu. Imenovanje koje klasificira enzime prema njihovim zadaćama važno je za određivanje zadataka pojedinih enzima.
Ilustracija enzima
enzimi
6 enzimskih klasa:
- oksidoreduktaze
(Oksidacija / redukcija) - transferaza
(Prijenos) - hidrolaze
(Upotreba vode) - liaze
(Cijepanje) - izomeraze
(ista molekularna formula) - ligases
(Reakcije dodavanja) - supstrati
- Aktivno središte
- Enzim / supstrat
kompleks - Enzim / proizvod
kompleks
Pregled svihslike Dr-Gumperta mogu se pronaći na: medicinske ilustracije
imenovanje
imenovanje enzim je uključen tri osnovna načela temelji.Nazivi enzima koji završavaju opisuju nekoliko enzima u sustavu. Sam naziv enzima opisuje reakciju koju enzim pokreće (katalizira). Naziv enzima također je klasifikacija enzima. Osim toga, kodni sustav koji EC brojački sustav, u kojem su enzimi proizvedeni pod numeričkim kodom četiri broja može se naći. Prvi broj označava enzimsku klasu. Popisi svih otkrivenih enzima osiguravaju brži pronalazak određenog enzimskog koda. Iako se kodovi temelje na svojstvima reakcije koju enzim katalizira, u praksi se numerički kodovi pokazaju neugodni. Sustavni nazivi temeljeni na gore navedenim pravilima koriste se češće. Na primjer, problemi s nomenklaturom nastaju primjerice enzimima koji kataliziraju nekoliko reakcija. Stoga ponekad postoji nekoliko imena za njih. Neki enzimi imaju trivijalna imena koja ne upućuju na to da je spomenuta tvar enzim. Budući da su se imena tradicionalno široko koristila, neka su zadržana.
Razvrstavanje prema funkciji enzima
Prema IUPAC i IUBMB, enzimi su podijeljeni u šest enzimskih klasa prema reakciji koju pokreću:
- oksidoreduktaze
Oksidoreduktaze pokreću redoks reakcije u pokretu. U ovoj kemijskoj reakciji, elektroni prelaze s jednog reakcijskog na drugog. Dolazi do oslobađanja elektrona (oksidacija) jedne tvari i preuzimanja elektrona (redukcija) drugom tvari.
Formula katalizirane reakcije je A + B a A + + B.
Tvar A oslobađa elektron (?) I oksidira, dok tvar B apsorbira taj elektron i smanjuje se. Zbog toga se redoks reakcije nazivaju i reakcijama redukcije-oksidacije.
Mnoge metaboličke reakcije su redoks reakcije. Oksigenaze prenose jedan ili više atoma kisika u svoj supstrat. - transferaza
Transferaze prenose funkcionalnu skupinu s jednog supstrata na drugi. Funkcionalne skupine su atomske skupine u organskim spojevima koje u velikoj mjeri određuju svojstva tvari i reakcijsko ponašanje. Kemijski spojevi koji imaju iste funkcionalne skupine grupiraju se u razrede tvari zbog sličnih svojstava. Funkcionalne skupine bit će podijeljene prema tome jesu li heteroatomi ili ne. Heteroatomi su svi atomi unutar organskih spojeva koji nisu ni ugljik ni vodik.
Npr .: -OH -> hidroksilna skupina (alkoholi) - hidrolaze
Hidrolaze razdvajaju veze u reverzibilnim reakcijama koristeći vodu. Esteri, esteri, peptidi, glikozidi, kiselinski anhidridi ili C-C veze. Reakcija ravnoteže je: A-B + H2O? A-H + B-OH.
Enzim koji pripada skupini hidrolaze je npr. Alfa galaktozidaza. - liaze
Lijaze, koje se još nazivaju i sintaze, kataliziraju cijepanje složenih proizvoda iz jednostavnih supstrata bez dijeljenja ATP-a. Reakcijska shema je A-B → A + B.
ATP je adenozin trifosfat i nukleotid, koji se sastoji od trifosfata nukleozida adenozina (i kao takav energetski bogat RNA nukleinske kiseline). Međutim, ATP je uglavnom univerzalni oblik trenutno dostupne energije u svakoj stanici i istodobno važan regulator procesa opskrbe energijom. Po potrebi, ATP se resintezira iz drugih zaliha energije (kreatin fosfat, glikogen, masne kiseline). Molekula ATP sastoji se od adeninskog ostatka, šećerne riboze i tri fosfata (? Do?) U esteru (?) Ili anhidridnih veza (? I?). - izomeraze
Izomeraze ubrzavaju kemijsku pretvorbu izomera. Izomerizam je pojava dva ili više kemijskih spojeva s potpuno istim atomima (ista empirijska formula) i molekulskih težina, koji se, međutim, razlikuju u povezanosti ili prostornom rasporedu atoma. Odgovarajući spojevi nazivaju se izomeri.
Ti se izomeri razlikuju u kemijskim i / i fizikalnim, a često i u biokemijskim svojstvima. Izomerija se javlja prvenstveno s organskim spojevima, ali i s (anorganskim) koordinacijskim spojevima. Izomerija je podijeljena na različita područja. - ligases
Ligaze kataliziraju stvaranje tvari koje su kemijski složenije od supstrata koji se koriste, ali su za razliku od lizaza samo enzimski učinkoviti s cijepanjem ATP-a. Stoga je za stvaranje ovih tvari potrebna energija koja se dobiva cijepanjem ATP-a.
Neki enzimi mogu katalizirati nekoliko, ponekad vrlo različitih reakcija. Ako je to slučaj, oni su raspoređeni u nekoliko enzimskih klasa.
Možda će vas zanimati i ovi članci:
- Alfa-glukozidaze
- lipaza
- tripsina
Razvrstavanje prema strukturi enzima
Gotovo svi enzimi su proteini i mogu se klasificirati prema duljini lanca proteina:
- monomeri
Enzimi koji se sastoje od samo jednog lanca proteina - oligomeri
Enzimi koji se sastoje od više proteinskih lanaca (monomera) - Višeenzimski lanci
Nekoliko agregiranih enzima koji međusobno surađuju i reguliraju. Ti enzimski lanci kataliziraju uzastopne korake u staničnom metabolizmu.
Pored toga, postoje pojedinačni lanci proteina koji sadrže nekoliko enzimskih aktivnosti, koji se nazivaju višenamjenski enzimi.
Razvrstavanje prema kofaktorima
Druga klasifikacija je klasifikacija prema razmatranju kofaktora. Kofaktori, koenzimi i ko-supstrati nazivi su za različite klasifikacije tvari koje utječu na biokemijske reakcije svojom interakcijom s enzimima.
Razmatraju se organske molekule i ioni (uglavnom ioni metala).
Čisti proteinski enzimi sastoje se isključivo od proteina, a aktivno središte se stvara samo iz aminokiselinskih ostataka i peptidne okosnice. Aminokiseline su klasa organskih spojeva sa najmanje jednom karboksi skupinom (-COOH) i jednom amino skupinom (-NH2).
Holoenzimi se sastoje od proteinske komponente, apoenzima i kofaktora, molekule male molekularne mase (nije proteina). Oboje zajedno važni su za funkciju enzima.
koenzima
Organske molekule kao kofaktori nazivaju se koencimi. Ako su kovalentno vezani za apoenzim, nazivaju se protetske skupine ili ko-supstrati. Protetska skupina je naziv koji se koristi za opisivanje neproteinskih komponenti čvrsto (obično kovalentno) vezanih za protein s katalitičkim učinkom.
Kozubstrati su nazivi za različite klasifikacije tvari koje utječu na biokemijske reakcije svojom interakcijom s enzimima. Kao biokatalizatori, molekule ubrzavaju reakcije u organizmima, enzimi ubrzavaju biokemijske reakcije. Oni smanjuju aktivacijsku energiju koju je potrebno savladati da bi se tvar mogla pretvoriti.